Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRMUO75648 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms