Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPBD1B2RD01 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms