Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms