Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3Q9UJ98 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
STAG3Q9UJ98 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STAG3Q9UJ98 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STAG3Q9UJ98 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STAG3Q9UJ98 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STAG3Q9UJ98 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3Q9UJ98 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3Q9UJ98 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3Q9UJ98 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3Q9UJ98 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms