Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUNDC2Q9BWH2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUNDC2Q9BWH2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms