Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms