Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDS1Q92903 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS1Q92903 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms