Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPAP2Q8IXW5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms