Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms