Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms