Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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