Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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