Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms