Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms