Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NME5P56597 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms