Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JRKO75564 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JRKO75564 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JRKO75564 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms