Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRTO14522 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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