Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8B2A6NJW9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms