Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms