Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms