Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms