Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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