Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms