Protein–RNA interactions for Protein: Q99551

MTERF1, Transcription termination factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF1Q99551 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTERF1Q99551 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms