Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms