Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PQLC2Q6ZP29 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PQLC2Q6ZP29 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms