Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms