Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RTL6Q6ICC9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RTL6Q6ICC9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL6Q6ICC9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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