Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR44Q5JSH3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms