Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COX10Q12887 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX10Q12887 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX10Q12887 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX10Q12887 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms