Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms