Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms