Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms