Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPOP42166 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPOP42166 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPOP42166 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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