Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD247P20963 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD247P20963 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms