Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms