Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB4P16144 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms