Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLIN3O60664 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms