Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 GCDH-206ENST00000587832 791 ntTSL 216.37■□□□□ 0.211e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-203ENST00000585420 1730 ntTSL 216.36■□□□□ 0.211e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-213ENST00000590627 1051 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.181e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-205ENST00000587072 453 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-210ENST00000590445 496 ntTSL 415.26■□□□□ 0.031e-7■■□□□ 11.4
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PRPF4O43172 GCDH-208ENST00000588905 562 ntTSL 514.71□□□□□ -0.051e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-204ENST00000585760 475 ntTSL 213.78□□□□□ -0.21e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 F2-202ENST00000442468 1031 ntTSL 319.97■□□□□ 0.794e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 34.01□□□□□ -1.774e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.962e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)26.51■■□□□ 1.832e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 525.99■■□□□ 1.752e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.752e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 524.11■■□□□ 1.452e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 523.83■■□□□ 1.42e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 522.87■■□□□ 1.252e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 520.92■□□□□ 0.942e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 320.55■□□□□ 0.882e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 220.36■□□□□ 0.852e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 519.78■□□□□ 0.762e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 517.08■□□□□ 0.332e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 216.96■□□□□ 0.312e-8■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NFE2L2-210ENST00000462023 521 ntTSL 214.8□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NFE2L2-214ENST00000588123 814 ntTSL 58.99□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NFE2L2-213ENST00000586532 942 ntTSL 54.68□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-8■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 DERL2-211ENST00000575209 786 ntTSL 210.13□□□□□ -0.792e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 ITIH3-205ENST00000465243 824 ntTSL 59.69□□□□□ -0.862e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 DERL2-205ENST00000571971 617 ntTSL 38.42□□□□□ -1.062e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 ITIH3-203ENST00000463893 529 ntTSL 47.89□□□□□ -1.152e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 DERL2-209ENST00000574700 1087 ntTSL 37.44□□□□□ -1.222e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.52e-8■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 DERL2-203ENST00000571476 570 ntTSL 34.62□□□□□ -1.672e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 PDS5B-209ENST00000498550 4238 ntTSL 1 (best)3.68□□□□□ -1.822e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 PDS5B-204ENST00000466078 1889 ntTSL 23.65□□□□□ -1.822e-8■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 PDS5B-203ENST00000450460 5246 ntTSL 1 (best)2.11□□□□□ -2.072e-8■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 ACADVL-216ENST00000578824 720 ntTSL 210□□□□□ -0.811e-7■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.995e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.284e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.964e-6■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 MCF2L-201ENST00000261963 2419 ntTSL 1 (best)23.53■■□□□ 1.363e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.22e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.814e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.614e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 UGDH-208ENST00000510490 534 ntTSL 418.45■□□□□ 0.544e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 BBC3-206ENST00000601438 1747 nt18.32■□□□□ 0.526e-9■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 218.06■□□□□ 0.486e-9■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.484e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 UGDH-211ENST00000515021 861 ntTSL 517.71■□□□□ 0.434e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 LMBR1L-209ENST00000548983 522 ntTSL 417.11■□□□□ 0.334e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.324e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 ITGB5-207ENST00000481591 1202 ntTSL 516.83■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 LMBR1L-217ENST00000551115 965 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.284e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.254e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 RPH3AL-208ENST00000572866 434 ntTSL 316.3■□□□□ 0.24e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 AL137003.1-202ENST00000450930 635 ntTSL 216.1■□□□□ 0.174e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.166e-9■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.114e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 515.67■□□□□ 0.16e-9■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CRIP3-204ENST00000451294 474 ntTSL 315.66■□□□□ 0.14e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.16e-9■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 UGDH-203ENST00000503779 575 ntTSL 415.43■□□□□ 0.064e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 UGDH-207ENST00000509391 577 ntTSL 315.43■□□□□ 0.064e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 ITGB5-209ENST00000488466 971 ntTSL 515.41■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 UGDH-210ENST00000514106 568 ntTSL 415.3■□□□□ 0.044e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 UGDH-212ENST00000515398 584 ntTSL 515.3■□□□□ 0.044e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 MCF2L-211ENST00000413354 952 ntTSL 515□□□□□ -0.013e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.086e-9■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CRIP3-207ENST00000487744 771 ntTSL 214.39□□□□□ -0.114e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 LMBR1L-221ENST00000551535 874 ntTSL 213.98□□□□□ -0.174e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 RHOC-219ENST00000534717 574 ntTSL 313.95□□□□□ -0.184e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.224e-6■□□□□ 11.3
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