Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms