Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms