Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPR88Q9GZN0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms