Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BSXQ3C1V8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BSXQ3C1V8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BSXQ3C1V8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BSXQ3C1V8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BSXQ3C1V8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BSXQ3C1V8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BSXQ3C1V8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BSXQ3C1V8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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