Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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