Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPSQ13938 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms