Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGDRQ13258 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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