Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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