Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP53609 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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