Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms