Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC4A6NH21 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms